السيد جعفر مرتضى الحسيني العاملي ابن المرحوم العلامة السيد مصطفى مرتضى ، ولد في 25/2/1364 هـ. الموافق لـ 6/1/1945 م. في بلدة جنوبية تدعى دير قانون رأس العين، التي كان قد سكنها والده عدة سنوات، ثم عاد برفقتهما إلى بلدته عيثا الزط التي غير اسمها لاحقاً ليصبح عيثا الجبل ، قضاء بنت جبيل ، واستقر فيها.
بدأ بتحصيل العلوم الدينية منذ صغره على يد والده ، ثم توجه إلى النجف الأشرف لمتابعة تحصيله العلمي وذلك سنة 1382هـ. الموافق 1962م.
وقد درس المقدمات وأكثر السطوح، ثم في سنة 1388 هـ. قرر الانتقال إلى الحوزة العلمية في مدينة قم المقدسة وذلك نزولاً عند رغبة والده رحمه الله ، وموافقة للاستخارة.
وللسيد كتابات تخصصية في مجال التاريخ وكانت مميزة من حيث التحقيق والتنقيب حيث شمر عن ساعد الحد في مجال البحث والقصي بهدف حفظ الإرث المحمدي العلوي وتنقيته من الشوائب.
بدأ قول الشعر في صغره ، فقال له والده: " أريدك عالماً ولا أريدك شاعراً " ثم ضرب له مثلاً كبار العلماء، حيث غلب عليه الشعر ونسيت خصوصيته العلمية.
أسس في مدينة قم المقدسة بعض المدارس الدينية. بالإضافة إلى نشاطات متنوعة أخرى..
شارك في العديد من المؤتمرات العلمية في إيران وغيرها وأسهم في تأسيس ما يسمى بالمدرسة العربية التابعة للحوزة العلمية في قم المقدسة.
حاز كتابه المعروف بـ "الصحيح من سيرة النبي الأعظم (ص)" على جائزة الكتاب الأول في الجمهورية الإسلامية عـام 992م. وهو من أهم الكتب في بابه.
عاد إلى جبل عامل أواخر سنة 1993 م.
أسس مدرسة دينية في لبنان "باسم حوزة الإمام علي بن أبي طالب(ع)" وأنشأ المركز الإسلامي للدراسات. وهو يقوم بتدريس الدروس الحوزوية العليا في بيروت .
له العديد من المؤلفات غالبها متخصص في التاريخ الإسلامي.
هذا ونعى المجلس الإسلامي الشيعي الأعلى إلى اللبنانيين والمسلمين وفاة فقيد العلم سماحة العلامة السيد جعفر مرتضى، مؤكدا أنه كان العالم الفذ الذي أغنى المكتبة الإسلامية والعربية بأبحاثه ومؤلفاته، والذي خسرت الحوزات والمراكز الدينية برحيله استاذا فقيها وباحثا رصينا وعلما كبيرا.
بعض مؤلفاته تُرجم إلى الفارسية.
منها: الصحيح من سيرة النبي الأعظم (ص). يتحدث عن سيرة النبي محمد (ص)، ويقع في خمس وثلاثين مجلدا، وقد حاز هذا الكتاب على جائزة كتاب العام في إيران.
الصحيح من سيرة الإمام علي (ع). يتحدث عن سيرة علي بن أبي طالب (ع)، ويقع في ثلاث وخمسين مجلدا.
1 - الآداب الطبية في الإسلام
2 - ابن عباس وأموال البصرة
3 - ابن عربي سنيّ متعصب
4 - الأبواب في عهد الرسول صلى الله عليه وآله: نصوص وآثار..
5 - أبو ذر لا إشتراكية.. ولا مزدكية
6 - أحيـوا أمـرنا
7 - إدارة الحرمين الشريفين في القرآن الكريم
8 - أسئلة وردتنا
9 - إسرائيل.. في آيات سورة بني إسرائيل.. تفسير ثمان آيات..
10 - الإسلام ومبدأ المقابلة بالمثل
11 - الإعتماد في مسائل التقليد والإجتهاد (صدر منه جزء واحد)
12 - أفلا تذكرون «حوارات في الدين والعقيدة»
13 - أكذوبتان حول الشريف الرضي
14 - الإمام علي والنبي يوشع صلى الله وآله
15 - الأمانة الإلهية.. لمن؟! ولماذا؟!
16 - أهل البيت عليهم السلام في آية التطهير
17 - أين الإنجيل؟!
18 - بحث حول الشفاعة
19 - براءة آدم عليه السلام حقيقة قرآنية
20 - براءة يونس عليه السلام في القرآن الكريم
21 - البنات ربائب.. قل: هاتوا برهانكم
22 - بنات النبي صلى الله عليه وآله أم ربائبه؟!
23 - بيان الأئمة وخطبة البيان في الميزان
24 - تخطيط المدن في الإسلام
25 - تفسير سورة ألم نشرح
26 - تفسير سورة البيِّنة
27 - تفسير سورة التكاثر
28 - تفسير سورة التوحيد (الإخلاص)
29 - تفسير سورة التين
30 - تفسير سورة الضحى
31 - تفسير سورة العاديات
32 - تفسير سورة الفاتحة
33 - تفسير سورة الفلق
34 - تفسير سورة الكافرون
35 - تفسير سورة الكوثر
36 - تفسير سورة الماعون
37 - تفسير سورة المسد
38 - تفسير سورة الناس
39 - تفسير سورة النصر
40 - تفسير سورة هل أتى (جزءان)
41 - توجيهات في العمل الإداري
42 - توضيح الواضحات من أشكل المشكلات
43 - الجزيرة الخضراء ومثلث برمودا؟!
44 - الحاخام المهزوم
45 - حديث الإفـك
46 - حقائق حول القرآن الكريم
47 - حقوق الحيوان في الإسلام
48 - حل الألغاز (تعليقة).
49 - الحياة السياسية للإمام الجواد عليه السلام
50 - الحياة السياسية للإمام الحسن عليه السلام
51 - الحياة السياسية للإمام الرضا عليه السلام
52 - خسائر الحرب وتعويضاتها
53 - خلفيات كتاب مأساة الزهراء عليها السلام (ستة أجزاء)
54 - دراسات وبحوث في التاريخ والإسلام (أربعة أجزاء)
55 - دراسة في علامات الظهور
56 - دليل المناسبات في الشعر
57 - ربائب الرسول صلى الله عليه وآله «شبهات وردود»
58 - رد الشمس لعلي عليه السلام
59 - زواج المتعة (تحقيق ودراسة) (ثلاثة أجزاء)
60 - الزواج المؤقت في الإسلام (المتعة)
61 - زوجات الإمام الحسن عليه السلام: أكاذيب وحقائق
62 - زينب ورقية في الشام!!
63 - سلمان الفارسي في مواجهة التحدي
64 - سنابل المجد (قصيدة مهداة إلى روح الإمام الخميني وإلى الشهداء الأبرار)
65 - السوق في ظل الدولة الإسلامية
66 - سياسة الحرب في دعاء أهل الثغور
67 - سيرة الحسن عليه السلام في الحديث والتاريخ (المجتبى من سيرة المجتبى) 12 جزء
68 - سيرة الحسين عليه السلام في الحديث والتاريخ (أربعة وعشرون جزءاً)
69 - شبهات يهودي
70 - الشهادة الثالثة في الأذان والإقامة
71 - الصحيح من سيرة الإمام علي عليه السلام (ثلاثة وخمسون جزءاً)
72 - الصحيح من سيرة النبي الأعظم صلى الله عليه وآله (خمسة وثلاثون جزءاً)
73 - صراع الحرية في عصر الشيخ المفيد
74 - طريق الحق (حوار مع عالم جليل من أهل السنَّة والجماعة)
75 - ظاهرة القارونية من أين؟! وإلى أين؟!
76 - ظلامة أبي طالب عليه السلام
77 - ظلامة أم كلثوم
78 - عاشوراء بين الصلح الحسني والكيد السفياني
79 - عاد الثانية.. كيف نعرفها؟! (هذا الكتاب)
80 - عصمة الملائكة بين فطرس.. وهاروت وماروت
81 - علي عليه السلام والخوارج (جزءان)
82 - عهد الأشتر مضامين ودلالات (جزءان)
83 - الغدير والمعارضون
84 - القول الصائب في إثبات الربائب
85 - كربلاء فوق الشبهات
86 - لست بفوق أن أخطئ من كلام علي عليه السلام
87 - لماذا كتاب مأساة الزهراء عليها السلام؟!
88 - مأساة الزهراء عليه السلام (جزءان)
89 - مختصر مفيد (أسئلة وأجوبة في الدين والعقيدة)، (واحد وعشرون جزءاً)
90 - مراسم عاشوراء «شبهات وردود»
91 - المسجد الأقصى أين؟!
92 - المعجزات: رقي وغايات، للبشر في الحياة
93 - مقالات ودراسات
94 - من شؤون الحرب في الإسلام
95 - منطلقات البحث العلمي في السيرة النبوية
96 - المواسم والمراسم
97 - موقع ولاية الفقيه من نظرية الحكم في الإسلام
98 - موقف الإمام علي عليه السلام في الحديبية
99 - ميزان الحق «شبهات وردود» (أربعة أجزاء)
100 - نقش الخواتيم لدى الأئمة عليهم السلام
101 - وقفات مع ناقد
102 - الولاية التشريعية
103 - ولاية الفقيه في صحيحة عمر بن حنظلة
104 - الگوی سیره پژوهی واندیشه های اسلامی (فارسي)
105 - تحقيقي در باره تاريخ هجري (فارسي)