يُقسم كتاب الفهرست إلى عشرة فصول؛ يتطرّق الكاتب في كل فصل منها إلى مواضيع في غاية الأهمية، وهي: الكتب السماوية المقدسة، أعمال الصرف والنحو واللغة، التاريخ والسير والجغرافيا، الشعر، علم الكلام، والفقه، والحديث، والفلسفة، والعلوم القديمة، والأساطير والحكايات والسحر، ومقالات عن غير الموحدين، وأخيراً الكيمياء.